遗传分析模型软件
(1)DNA标记方法中,现在最有效的是用微卫星标记(如SSR标记),但是微卫星有时候不好扩增,可能需要较长的摸索时间;因此RFLP和AFLP等老方法也可以一用,优点是速度快。
(2)对于遗传多样性分析来说,等位酶分析更好。同工酶是功能相同的一类蛋白质,但是它们的编码基因不同,因此并不能很好的反应同种不同种群或近缘种间的遗传多样性关系;等位酶是由同一个基因的不同等位基因编码的,有进化上的关系,更适合用于遗传多样性分析。
(3)蛋白质水平上,可以用凝胶电泳技术检验蛋白质条带的多态性(这是也比较常用的);也可以直接蛋白质测序,但是这个成本高,并且有些蛋白测序难度大。
怎样使用popgen软件处理SSR标记数据?
操作如下:
确定数据输入格式。对于共显性分子标记,我是用基因型来统计数据的。数据的录入格式具体看popgene.pdf文章。共显性分子标记标记数据从 Load date--Co-Dominant Marker Date 调入,之后再在菜单栏中选Co-Dominant按钮,在下拉菜单中,单倍体选择Haploid Date 多倍体选择Diploid Date。在余下的选择参数上,具体看popgene.pdf文章。以上是我用该软件分析SSR数据时的一点体会。若你在网上搜捕到popgene.pdf实用说明书,我可以发给你。qiaopeng3000buy@163.com